Chaque extrémité du pont est protégée par une tour. Celle de Malá Strana date de 1464 et domine la tour Judith datée de la deuxième moitié du XIIe siècle. Cette tour faisait partie de l'ancien pont Judith et a remplacé une ancienne tour romane. L'architecture et la décoration de la tour Judith ont été restaurées vers la XVIe siècle. La tour gothique de Staré Město date, elle, du XIVe siècle.

Le pont Charles est venu remplacer le pont Judith édifié quelques mètres en amont et qui fut emporté par une crue de la Vltava en 1342. Jusqu'en 1741, c'était le seul pont qui enjambait la rivière. C'est aujourd'hui un haut lieu touristique de la ville qui attire aussi les musiciens, les peintres et divers artistes.

La Renaissance tardive (aussi appelé « le maniérisme ») se diffuse à Prague au cours du XVIe siècle comme dans le reste de l'Europe. Le maniérisme rompt avec l’exactitude des proportions, l’harmonie des couleurs ou la réalité de l’espace. Les artistes cherchent à produire un nouvel effet émotionnel et artistique. Sous le règne de Rodolphe II de Habsbourg (1552-1612), de 1583 à 1620, la Bohême voit affluer des artistes et savants venus de toute l’Europe. Les monuments marquants sont le Belvédère du Jardin Royal et le jardin Renaissance du Palais Wallenstein.

Le baroque est l'expression même de la Contre-Réforme. Ce mouvement artistique rétablit la domination du catholicisme et des Habsbourg sur Prague, ville qui a accueilli Jan Hus (mort supplicié en 1415), précurseur de la Réforme et du protestantisme. L’église Saint-Nicolas, à Malá Strana, construite par les jésuites de 1673 à 1752, est la construction baroque la plus somptueuse et emblématique de Prague. La capitale de la Bohême est ainsi l’une des plus belles villes baroques du monde.

Le mouvement de l'Art nouveau à Prague a donné l'occasion aux artistes tchèques, hongrois et polonais de réaffirmer leurs aspirations à l'indépendance de leurs peuples à l’égard de l’Autriche-Hongrie. Ce mouvement artistique redessine l’extérieur et l’intérieur des bâtiments : façades, escaliers, décorations intérieures... L'artiste pragois le plus célèbre est ainsi Alfons Mucha (1860-1939), de renommée internationale. Prague lui a d'ailleurs consacré un musée. Les principales réalisations de ce courant artistique sont la Maison municipale et la Gare municipale de Prague.

L’architecture cubiste est visible sur plusieurs bâtiments de Prague. Le siège de la Légiobanka dans la rue Na Poříčí, construit entre 1921 et 1923, est un monument classé par l’UNESCO en tant que représentation unique du rondocubisme, mouvement créé par l’artiste tchèque Josef Gočár. Cet architecte a également réalisé la Maison à la Vierge noire dans la Vieille Ville. Elle accueille aujourd'hui le Musée du cubisme de Prague. La Maison Diamant, construite entre 1912 et 1913, dans le quartier de Nové Město, est également un bâtiment cubiste.

La ville de Prague a, bien sûr, été imprégnée par le réalisme socialiste durant la période de la domination russe. Les HLM pragois ressemblent alors à ceux des autres pays du bloc soviétique. Une énorme statue à la gloire de Staline a été érigée, entre 1949 et 1955, dans le parc de Letná. Elle mesurait 15,5 mètres de haut et 22 mètres de longueur. Elle a été détruite en 1962 au moment de la déstalinisation. La tour de transmission de Žižkov, construite à l'époque de la République socialiste, entre 1985 et 1992, sert aujourd'hui de transmetteur pour la télévision, la radio, la téléphonie mobile et fait aussi office d'observatoire météorologique. Elle accueille un restaurant situé à 63 mètres de hauteur. Au pied de la tour, des sculptures de bébés, œuvre de l’artiste David Černý, montent à l’assaut de l'édifice.

L'architecture contemporaine à Prague est principalement incarnée par la Maison dansante située sur les quais de la Vltava et réalisée par les architectes Vlado Milunić et Frank Gehry. Construit en 1996, cet immeuble est un exemple d'architecture déconstructiviste.

Place de la Vieille-Ville, l'église de Notre-Dame de Týn fait partie des plus beaux monuments gothiques de Prague. Ses flèches identiques, mais construites l'une au XVe siècle et la seconde au XVIe siècle, s'élancent vers le ciel jusqu'à une hauteur de 80 mètres. L'édifice doit son nom à la cour de Týn, une ancienne cour de marchands située à proximité. L'église a été construite, dans la seconde moitié du XIVe siècle, à l'emplacement d'une ancienne église romane du IVe siècle. L'architecte français Mathieu d'Arras a entrepris sa construction dans le style gothique, en 1380, avec l'aide de Peter Parler. La toiture a été achevée en 1450 et les clochers en 1511. Le fronton date de 1436. En 1626, la voûte a été touchée par la foudre. Elle a alors été refaite dans le style baroque, à l'instar de l'intérieur de l'édifice. Depuis, l'extérieur a été rénové à deux reprises, à la fin du XVIIIe siècle et entre 1973 et 1995. Des travaux de restauration partiels ont été récemmment entrepris à l'intérieur de l'église.

Symbole du Renouveau national, le Théâtre national, qui se caractérise par ses éléments architecturaux néo-Renaissance, est le plus important monument édifié à Prague au XIXe siècle. La première pierre du théâtre fut posée en 1868. En 1881, deux mois après son inauguration, le bâtiment est détruit par un incendie. Il est renconstruit en un temps record par Josef Schulz. L'intérieur est richement décoré. Huit allégories décorent le plafond du musée. Celui-ci abrite aussi la création de Vojtěch Hynais, un somptueux rideau de scène, orné de motifs allégoriques représentant la construction du théâtre.

La Maison dansante est vraisemblablement le monument le plus célèbre construit sur les rives de la Vltava, après la révolution de Velours en 1989. Ses formes dansantes et flottantes évoquent l’atmosphère de liberté qui régnait en Tchécoslovaquie à la chute du régime communiste. La Maison dansante a été construite à un emplacement resté vacant à la suite des bombarbements de 1945. C’est dans l’appartement du dramaturge et dissident Václav Havel, qui habitait dans l'immeuble voisin, que germa l’idée de construire un bâtiment qui soit le symbole de la liberté reconquise. La Maison dansante a été conçue par l’architecte tchèque Vlado Milunić, en coopération avec l'architecte canadien Frank Gehry.